这些年，随着资本市场的活跃，并购重组等交易日益增加，税务稽查的次数越来越多，力度越来越大，尤其是“股权转让”方面。那么，在公司股权转让的过程中，哪些行为会被重点稽查呢？常见的问题都有哪些？接下来，我来带你详细了解~
一、未申报纳税
发生股权转让行为但不申报缴纳相应税款的，股权转让双方属于不缴应纳税款的偷税行为，将会受到相应税务行政处罚，被投资企业若未履行报送材料的义务，亦有可能受到行政处罚。
随着税收征管的深化改革，税务机关与工商部门逐步落实和完善股权信息交换制度，个人股权转让信息自动交互机制的广泛推行，纳税人想要通过不申报纳税逃避税款的目的将无法实现，否则将面临虽转让股权但不办理变更登记的法律风险。
二、股权转让价款存疑
根据实践经验，股权转让价款存疑可能表现为0元转让、1元转让、等额转让、企业盈利但转让价格不合理的折价转让、同一企业短期内股权转让存在较大差异等情形，若股权转让价款存疑，可能引发税务机关核定征收的情形。
并非只要价格不合理即引发税务机关核定征收，若纳税人能够证明该价格明显偏低是基于正当理由，则税务机关将以股权转让双方意定的价款予以计算应纳税额。
三、虚假申报纳税、提供资料不完整
纳税人存在虚假申报纳税，办理股权转让纳税或扣缴申报时提供的资料不完整，引发税务机关合理怀疑的将可能成为税务稽查重点对象，如不能提供完整且准确的股权原值证明材料；
提供的股权转让合同内容可能引发偷逃税款合理怀疑的，如载明“双方实际股权转让价款以实际付款为准”等内容；
依法应当进行资产评估但未能提供或拒不提供有效的资产价值评估报告的；
股权转让价款明显偏低但不能提供有效的证明材料等情形。
四、提供资料不完整
根据《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》，各地税务机关加强个人股权转让的动态管理，建立股权转让个人所得税电子台账，将自然人股东的相关信息录入征管信息系统，强化对每次股权转让间股权转让收入和股权原值的审核，同时伴随个人股权转让信息自动交互机制在全国范围的广泛推行，同一自然人股东在一定期限内频繁发生股权转让行为或同一企业或关联企业的股权一定期限内频繁被转让的，将被识别并作为税务稽查重点对象。
五、企业发生注册资本变动
当企业发生注册资本变动时，可能涉及引入投资者导致注册资本增加亦可能通过资本公积转增股本，或企业减少注册资本时，可能引发自然人股东个人所得税纳税义务的产生，因此当企业注册资本发生变化时，可能成为税务稽查的重点对象。
该转增股本的资本公积，属于股本溢价发行形成的资本公积，不应缴纳个人所得税。检查人员检查发现，该企业资本公积形成于2013年，是一家医药公司直接股权投资形成的，没有股票发行过程，属于投资者投入形成的资本公积增加，而非股票溢价发行形成，不符合上述文件的要求，应缴纳个人所得税，最终做出补缴个人所得税756万元，罚款378万元的处罚决定。
六、交易双方因股权转让发生纠纷
交易双方因股权转让事宜发生纠纷，引发诉讼或仲裁时，可能导致税务机关对该股权转让行为的重点关注。
这六种行为都是在股权转让过程中最容易发生的，今天我为大家总结再次，希望对大家有所帮助，大家快来学习一下吧，如果对相关还有想要了解的，欢迎咨询。